数据处理

canoco4.5中文版是很专业的一个生态数据分析软件，安装之后用户可以将本地储存的生态数据导入其中，能够通过更加一目了然的图表来呈现出来，整体更直观，还能将不同的数据分析做一个对比，详细的数据显示对于用户来说能够提供较大的参考价值。

canoco4.5软件介绍：

canoco4.5有助于制作更好的发布质量排序图，而且它还可以直接测试所有约束轴，并将两个排序结果与Procrustes分析进行比较。此外，它的分析和绘图功能与易于使用的电子表格数据编辑器集成在一个程序中。

canoco4.5安装教程：

下载安装包后第一步就是解压，双击程序打开。

进入安装向导，点击next。

阅读安装相关事项，下一步。

填写用户名、公司、序列号。

选择安装位置，可自行更改。

勾选需要的组件，默认下一步。

确认安装信息，点击yes即可。

canoco4.5冗余分析步骤：

新建两个excel工作表，整理样品数据，整理完成后，分别复制这两个工作表的数据区域。

电脑左下角点选开始CANOCO for windows-WcanoIMP。

打开界面后选择save in condensed format后点击SAVE。

点击保存按扭后，之前在EXCEL复制的两个数据表会保存为两个DAT文件，ENVIRON.DAT与SPECIES.DAT。

用记事本可以打开这两个文件，打开canoco软件。菜单栏点选FILE-NEW project打开AVAILABLE DATA界面。

点选species and environmental data available，以及EXTRACT PATTERNS FROM THE EXPLAINED VARIATION ONLY后点下一步。

弹出DATA FILES的窗口，SPECIES与ENVIRONMENT这两项分别点击BROWSE选择之前保存的两个DAT文档。

建立一个空的文本文档，将后缀改为.sol。在回到DATA FILES窗口。

在Canoco solution file name下点击Browse选择这个文档即可。

然后点击下一步进入TYPE OF ANALYSIS界面。

点选LINEAR下的RDA选项，然后点击下一步。

到GLOBAL PERMUTATION TEST界面，点选如下图设置，再点击下一步。

SCALING:LINEAR METHODS界面，focus scaling on 选择inter-species correlations, species scsores任意选一个，两个选项结果差不多，点击下一步。

进入TRANSFORMATION OF SPECIES DATA对话框，点选LOG TRANSFORMATION这一项，A与B均设置为1.0，点击下一步。

进入CENTERING AND STANDARDIZATION对话框，SAMPLES点选NONE, SPECIES点选CENTER BY SPECIES.点击下一步。

进入DATA EDITING CHOICES对话框，根据需要点选即可，如下图解释，选择后点击下一步。

进入FORWARD SELECTION OF ENVIRONMENTAL VARIABLES, 点选AUTOMATIC SELECTION或MANUAL SELECTION以及USE MONTE CARLO PERNUTATION TESTS。

点击下一步后进入FINISH OPTIONS，点选后点击完成按扭，设置参数会保存为.con文件，选择保存路径与名称后点击保存按扭。

弹出PROJECT对话框，点击ANALYZE按扭开始分析。

如果第14步点选MANUAL SELECTION，此时会弹出手动预选的对话框如下图，选择左侧变量点击INCLUDE VARIABLE将变量加入分析项中，完成后点STOP SELECTION完成。

最后在LOG中显示分析结果，保存LOG文件为.con文件。

用CanoDraw for windows打开分析结果CON文件，保存作图结果在CDW文件中。

菜单栏点选CREAT-BIPLOT AND JOINT PLOTS-SPECIES AND ENV.VARIABLES，美化排序图即可

菜单栏点选FILE-EXPORT选择导出格式后导出分析结果图。